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线上网赌网站大全生物信息学研究人员梅德korkin检查新的冠状病毒的关键蛋白的3D模型。

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线上网赌网站大全研究员股科学家冠状病毒的3D全球路线图

教授梅德korkin和同事重建新的冠状病毒的三维模型;研究结果提供研究社区感染蔓延和可能的治疗的更好的理解

2020年2月10日
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一线上网赌网站(线上网赌网站大全)生物信息学研究人员创建并推出了全新的冠状病毒的三维结构路线图(2019-ncov),一大发展潜在持有的关键,了解致命病毒的传播和治疗。

使用武汉冠状最近公布的病毒基因组上提供 国家生物技术信息中心 网站, 梅德korkin 和一队的研究生用分子模型重建的主要病毒蛋白和它们与人类蛋白的相互作用的三维结构。

“我们相信,我们的数据和可视化模型可为世界各地的科学家实验谁正在紧张地忙碌着解决这一流行病的指导意见”,称korkin,在大学的线上网赌网站大全和导演计算机科学副教授 生物信息学和计算生物学程序.

实际上,korkin说,他和他的团队创造了一个结构基因组地图,将提供给研究人员和世界各地的人的冠状病毒。

“任何人都可以下载我们的模型,得到任何种类的信息,并用它来研究,”他说。 “这是怎样的数据驱动的科学能够迅速应对这一挑战。第一个例子”

这是怎样的数据驱动的科学能够迅速应对这一挑战的第一个例子中的一个。
梅德korkin
计算机科学副教授

完整的3D结构的路线图数据集和手稿预印本,可以发现 korkin的实验室网站,并且将可在biorxiv,在生命科学领域未发表的预印本一个免费的在线归档和分发服务由冷泉港实验室,一个不以营利为目的的研究和教育机构工作。给予对新的冠状病毒引起全球关注,korkin和世界各地的研究人员正在使用的网站关于该病毒的快速沟通。 

korkin和他的团队利用现有的公共数据库,以确定三个不同的菌株,或标本,在严重急性呼吸道症候群(SARS),于2003年确定了病毒也引起了世界范围内的感染和死亡人数显著。这些可能是新病毒的来源。根据世界卫生组织,已经有全球40,000多家的情况下,有超过900人死亡,主要是在已日益增多的国际机构合作,以阻止病毒的传播,开始在中国武汉,数字,中国在12月下旬。

 

“我们发现,这三个非典分离不仅是彼此相似,但是非常相似的新型冠状病毒,”他说。 “实际上的一个分离物95之间共享其蛋白序列的100%。”

在解释3D模型发现,korkin的理论是对的基因组序列,这是他比作牙齿上的多个插入钥匙可能会显示这种病毒是如何从其他冠状病毒如SARS和聚体不同。例如,尽管一些插入件可以从与病毒表面蛋白相互作用的阻断人抗体,结构分析表明,一些抗体能够与它相互作用。

扩展比喻,错键被用于尝试打开,将允许在对抗病毒的人类抗体一门门。

korkin和他的团队做出另外两个显著的​​发现。第一,线上网赌网站大全识别在其蛋白质结构从SARS冠状病毒的不同的位置。通过这个标识,他们能够理解这些差异的功能的影响。

第二,korkin能够审查SARS存在于公共数据库的候选药物,并能够查明可能导致新的冠状病毒治疗的潜在药物。

线上网赌网站大全教授梅德korkin解释出现的新型冠状病毒关键结构上的差异。

线上网赌网站大全研究员解释新兴的新型冠状键结构差异(2019-ncov)

korkin说,他相信这种数据驱动的方法将成为帮助解决一些世界上最大的健康挑战,如冠状病毒治疗的情况下的标准。

“我坚信,利用强大的生物信息学和数据驱动的方法,以生命科学将日益成为科学界的反应,以直接健康威胁的方式,”说korkin。

作为下一步,korkin将为研究团体更深入地了解这种新病毒的进化意义。

在研究加入korkin的线上网赌网站大全博士生红柱翠,紫阳高,刘明,陆森宝,全部来自中国;从乌克兰奥列克narykov;苏哈斯从印度斯里尼瓦桑;中国的硕士研究生莫太阳和马拉维的主人的富布赖特学者小熊mkandawire。

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Oleksandr Narykov in graduation regalia
narykov(与毕业典礼的朋友)在右侧。

一个学生的角度

“我希望我们的冠状病毒的研究工作提供了科学界的见解。”

奥列克narykov '21,一个博士生,是球队与梅德korkin研究响应covid-19工作的一部分。他们的突破与感染的蔓延和可能的治疗更深入的了解提供了科学界。阿列克时不工作,帮助解决全球急需解决的问题,他花时间与讲俄语的学生和学者协会,并计划通过一个博士后位置最终完成额外的研究培训。了解更多关于我们的生物信息学研究生课程。